[发明专利]一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法有效
| 申请号： | 202210991537.3 | 申请日： | 2022-08-18 |
| 公开（公告）号： | CN115064215B | 公开（公告）日： | 2023-10-24 |
| 发明（设计）人： | 王辉;王舒意;孙世俊;郭一凡;王启;李振中 | 申请（专利权）人： | 北京大学人民医院 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B20/30;G16B40/00;G16B50/00;G06F18/23;G06F18/22 |
| 代理公司： | 北京领创律师事务所 11778 | 代理人： | 沈斌;习文峰 |
| 地址： | 100044 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法，其包含如下步骤：a）将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对；b）根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果；c）根据筛选的比对结果计算簇相似度，选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇；d）从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株；e）从所述候选菌株中，选取株相似度最大的N个原始菌株，作为来源菌株；f）根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 通过 相似 进行 菌株 溯源 属性 鉴定 方法 | ||
【主权项】：
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